Древний город Караль стал своеобразной кульминацией первого культурного процесса, так называемого начального периода. Среди его основных характеристик: строительство шахматных самшитовых храмов, круглых площадей и небольших деревень вокруг мест поклонения. К этому периоду относятся такие известные археологические памятники, как «Сечин» на побережье Анкаша и «Храм скрещенных рук» в Котоше.
Спустя тысячу лет на севере центральной части Анд в регионе Анкаш зародилась Чавинская культура.
К 700 г. до н.э. на центральном побережье появилась еще одна удивительная культура — Паракас, культура первых великих поселенцев пустыни. Ее представители стали известны благодаря достижениям в области ткацкого искусства. В свое время их ткацкие технологии перевернули мир. Помимо этого, культура отличалась уникальными погребальными обрядами.
В течение первых веков н.э. и после гегемонии Чавинской культуры по всей территории страны расселялись различные племена. Среди них выделяются Мочика, которые распространили свою власть почти на все северное побережье Перу.
Около 550 г. н.э. появилась так называемая Первая региональная империя — Уари. Являясь продолжением культуры Тиауанако, возникшей в высокогорных районах Перу и Боливии, Уари доминировали на обширной территории и заложили основы того, что позже станет известно как Тауантинсуйо. Они были создателями первых доиспанских дорог и заложили основы социального управления на территории, которую позднее унаследуют инки Куско.
С исчезновением Уари примерно в 1200 г. н.э. начался поздний промежуточный период. Это уже вторая волна региональных событий, среди которых выделяется культура Чиму. Ее представители создали город Чан-Чан — крупнейший комплекс сооружений из глины в мире.
Этот период также считается временем Чачапойя, «народа облаков», обитателей густых предгорных лесов Амазонки, где они строили удивительные города и мавзолеи прямо в горном массиве.